La Fecec neix l’any 1979 en uns moments polítics i socials determinats, on la iniciativa de la societat civil oferia respostes a les mancances, en aquest cas educatives, del país. Col·lectius de pares i de mestres van engegar projectes educatius sota la forma jurídica de cooperativa ja que responia al sentir comú de coresponsabilitat i de compartir.
La federació amb presència a tot el territori català va anar desenvolupant les tasques de representació d’aquest col·lectiu que històricament ha passat per períodes complicats i diversos com ara el CEPEC, el Pacte de centres en crisi i la consolidació actual ja a partir de finals dels 90. L’any 1996 va constituir juntament amb el GAEC, l’Agrupació Escolar Catalana, una associació empresarial amb l’objectiu de representar les escoles en els àmbits que només com associació no els eren permesos, representació en el conveni col·lectiu i en les diferents meses de la negociació sectorial.
En aquests moments la Federació representa 40 escoles cooperatives, que apleguen 5.016 socis cooperativistes i 1.738 treballadors que eduquen i ensenyen 13.934 alumnes.
Les cooperatives d’ensenyament associades responen a tres tipologies diferenciades: cooperatives de treball associat (de mestres) que representen el 78%; cooperatives de consum (de pares) que representen el 20%; i cooperatives mixtes (de pares i mestres) que representen un 2%.